Em 2 de novembro de 1852, a Capela do Rio Vermelho foi incorporada à Paróquia de Nossa Senhora da Vitória. Os veranistas, que criaram a Festa de Senhora Sant'Ana (1870) e a Irmandade da Gloriosa Senhora Sant’Ana do Rio Vermelho (1882), também foram os responsáveis pela criação da Paróquia de Sant'Ana do Rio Vermelho. O ato foi assinado em 5 de abril de 1913, por dom Jerônymo Thomé da Silva, arcebispo metropolitano de São Salvador da Bahia e primaz do Brasil.
Com a criação da Paróquia, a Capela de Senhora Sant'Ana foi elevada à condição de Igreja Matriz. E assim permaneceu até a inauguração da nova Matriz, erguida no local onde existiu o Forte do Rio Vermelho, numa das extremidades da Enseada de Santana, na Rua Guedes Cabral. Foi inaugurada em 26 de julho de 1967, dia da Padroeira do Rio Vermelho.